Atmosfir akademik di lingkungan FMIPA Unesa berkembang secara solid melalui pelaksanaan tridharma perguruan tinggi dan kerjasama. Hal ini telah menciptakan proses akademik yang berkualitas pada masing-masing program studi dan relevan dalam mengembangkan potensi diri mahasiswa untuk menjadi lulusan yang berkarakter, professional, mandiri dan berdayasaing tinggi.
Sebagai pelaksana akademis, FMIPA Unesa mempunyai 4 jurusan dan menyelenggarakan 9 program studi. Kesemua prodi tersebut telah diakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT).