Dalam meningkatkan mutu dan soliditas atmosfir akademik serta untuk mendukung aktivitas riset dan studi, FMIPA Unesa melakukan kerjasama dengan berbagai industri, institusi, dan masyarakat nasional maupun internasional. Jumlah dan kualitas kerjasama tersebut telah menjadi pencitra positif bagi FMIPA Unesa terhadap stakeholder dan masyarakat.
Berbagai kerjasama yang telah dijalin FMIPA Unesa antara lain:
- DinasPendidikandansekolah-sekolah di JawaTimurdalamrangka:
a. peningkatanprofesional guru lewat workshop dan seminar sesuaibidangnya, sepertimateri assessment, workshop PMRI, PTK, danlain-lain
b. Pendampingan RSBI sejaktahun2004
c. Pendampinganolimpiade
d. Pelatihanpembuatan media pembelajaran
e. Pelatihanbidangbiotehnologikonvensional
f. Lesson Study
g. Penerimaan peserta didik baru (PPDB), seperti dengan Dinas Pendidikan Pemerintah Kabupaten Sidoarjo yang sudah berlangsung sejak tahun 2013.
2. Lembaga Pemerintahan seperti Dinas Pertanian dan PDAM dalam rangka pengembangan mitra untuk PKL dan Pemagangan bagi mahasiswa
3. Industri, antara lain PT. SIER, PT. Petrokimia Gresik, PT. Semen Gresik, PT. Miwon, PT. Unilever, PT. Adiprima Suryaprinta, dan PT. Telekomunikasi dalam rangka riset dan pemagangan mahasiswa
4. Lembaga-lembaga penelitian seperti BPPI, BTKL, Taman Nasional Alaspurwo, Dan Kebun Raya Purwodadi dalam rangka riset dan pemagangan mahasiswa.
5. Yayasan Pendidikan, MGMP SMP, SMA/SMK kota dan kabupaten di Jawa Timur melalui dalam rangka profesionalisme dosen sebagai narasumber seminar sesuai dengan keahlian yang dimiliki
6. Universiti Kebangsaan malaysia (UKM) dalam rangka student exchange seperti pengiriman 10 mahasiswa untuk program Credit Transfer
7. Stakeholder dan masyarakat dalam rangka profesionalisme dosen sebagai narasumber pelatihan ketrampilan manajemen laboratorium dan pelatihan untuk mengembangkan wawasan kewirausahaan.